循证医学（EBM）是 "有意识地、明确地、明智地利用当前的最佳科学研究证据，为患者的治疗做出决策"。EBM 于 20 世纪 90 年代在麦克马斯特大学（McMaster University）创立。它建立了一个系统，将系统研究中可获得的最佳外部证据、可用资源（临床专业知识、人员、设施、资金）和患者偏好整合在一起，从而根据经验得出临床结论。
EBM 是一种严格、严谨的临床研究形式，它遵循结构化、无偏见的研究方法，客观评估围绕医疗保健领域的整体证据状况，并识别文献中是否存在偏差，从而导致结论偏离事实。
EBM 的基础
EBM 的基础是通过进行系统综述/计量分析（SR/MA）形成的，系统综述/计量分析是对围绕某一领域或干预措施的整体证据进行评估的研究，目的是检查关联性、安全性和/或疗效和有效性。
研究人员通过以下步骤对文献进行总结，从而开展系统综述/荟萃分析：汇总围绕某一领域的全部文献；以叙述和定量的方式汇集每项研究的结果，以检查单项研究之间的关系；评估每项研究的偏倚风险；就结果的方向（有益或有害）和重要性（如果效果具有统计学意义和临床意义）得出结论。
进行系统综述和荟萃分析
要进行系统综述/荟萃分析，需要检索多个数据库、试验注册、会议摘要和灰色文献（grey literature），以确定与研究领域相关的所有文章。数据库检索通常会返回数百至数千篇文章。
对检索到的文献进行研究，以找到合适的文章纳入 SR/MA，这些文章应具有研究人员预先指定的特征。尽管搜索过程非常广泛，但如果试验结果从未发表过，那么最大限度地识别与主题相关内容的目标就会受到影响。比较已发表与未发表文献数量的研究结果表明：
- 在 807 项临床试验中，有 48% 未发表。
- 在 594 项临床试验中，50% 未发表。
- 在美国国立卫生研究院资助的 631 项临床试验中，只有不到一半在研究完成 30 个月后发表，三分之一在中位数 51 个月后仍未发表。
- 在 ClinicalTrials.gov 公布的 13,327 项临床试验中，只有 38.3% 报告了结果。
- 在 29,729 份提供随机对照临床试验结果的摘要中，37% 的摘要从未在正式出版物上发表过，而那些结果为阳性的摘要发表的可能性要高出 30%。
这些结果表明，生物医学领域有很大一部分文献从未发表过。当文献未被发表，或特定类型的文献被发表而其他文献未被发表时，就会出现报告偏差。例如，与统计上无意义或结果为阴性的研究相比，结果为阳性或统计上有意义的研究发表的几率要高 2.2-4.7；发表的速度更快（4-5 年对 6-8 年）；在影响因子较高的期刊上被引用的次数要多 1.6 倍。
由于发表论文是研究人员展示影响力的职业驱动机制，因此不利于研究人员压制成果。这些结果表明，出版偏差可能更多地受到出版商偏好的影响，而非研究人员的选择性报告。
传播成果
既然研究人员只能任由出版商选择 "值得 "发表的试验，那么研究人员可以利用什么机制来传播他们的结果呢？
为了减少发表偏差并确保所有研究成果都能被获取，研究人员可以将自己的研究成果发布到预印本服务器上，预印本服务器为共享研究成果提供了近乎有保障的机制。当研究人员在预印本资料库中发布自己的研究成果时，他们可以保护自己的研究成果不被剽窃，并确保他们的研究成果能被 EBM 研究人员发现，而不管期刊编辑做出什么决定（接受还是拒绝）。
通过数据库搜索确定所有可用文献至关重要，因为如果SR/MA中未包含可用试验（假设这些试验符合研究人员预先指定的纳入标准），可能会导致低估或高估结果、错误结论和不恰当的建议。
索引的价值
随着预印本传播和接收量的增长，预印本将越来越多地被EBM研究人员所依赖的数据库（如MEDLINE、CENTRAL、Embase和Science Citation Index）收录，以识别纳入SR/MA的文章。2013 年，平均每月发布 233 篇生物医学预印本，占当年所有已发表生物医学文献的 0.19%。截至 2020 年 6 月，平均每月发布 9,911 篇生物医学预印本，占 2020 年所有已发表生物医学文献的 8.08%。2020年，美国国立卫生研究院（NIH）启动了NIH预印本试点项目，该项目旨在 "通过PubMed Central（PMC）以及PubMed提供由美国国立卫生研究院（NIH）资助的研究产生的预印本"。
通过该试点项目，预印本可通过PMC和PubMed进行搜索，这些预印本由Research Square、bioRxiv、medRxiv、ChemRxiv、arXiv和SSRN等领先的预印本平台提供。此外，与美国的 PMC 相比，欧洲 PMC 索引了更多数据库中的 37,000 多份预印本，包括 Research Square、bioRxiv、PeerJ Preprints、ChemRxiv、F1000Research、Gates Open Research、Wellcome Open Res、HRB Open Research、AAS Open Research 和 MNI Open Research。
预印本和 EBM
尽管预印本是研究报告定稿的草稿，但它们在对 EBM 以及更广泛的医疗保健社区产生积极影响方面具有巨大潜力。EBM 并不歧视手稿的出版状态。重要的是，EBM 研究人员能够获得数据，而预印本正是向科学界提供数据的最佳途径。
通过发现和传播从研究中获得的知识，以及如何解释这些知识并将其转化为实践，为医疗保健服务。出版商可能会阻碍知识转化过程，妨碍将研究成果全面准确地应用于实践，而预印本则是研究人员打开出版商大门的钥匙。
最终，预印本与 EBM 的结合有可能提高临床建议的准确性和全面性。预印本引领着科学出版的未来，而 EBM 将从这种由研究人员驱动的无偏见传播机制中受益。
