计算机模拟研究概述
计算机模拟研究是在计算机上通过模拟进行的研究。计算机模拟常用于预测化合物与体内蛋白质或病原体的反应。
计算机模拟研究的常见应用包括
- 候选药物筛选（分子对接研究）
- 药物不良反应预测
- 全细胞模拟
- 测序（in silico PCR）
计算机模拟研究的优势
- 只需一台电脑和必要的软件，即可进行简单而廉价的分析。在 2020 年 COVID-19 大流行的全球封控期间，许多研究人员能够通过计算机模拟方法为研究工作做出贡献。
- 这些研究不使用人体、动物模型或细胞培养，因此通常不需要伦理监督或专用设备。
- 与其他类型的研究相比，获得结果的速度极快。
- 分子对接（Molecular docking）研究可用于快速评估将已知药物重新用于治疗新疾病的可行性，并探索脱靶相互作用可能产生的副作用。
计算机模拟研究的注意事项
- 小分子与蛋白质之间的实际相互作用仍有赖于现实实验的验证。
- 分子对接研究探索药物治疗疾病的潜在疗效，其结果往往不能很好地转化为在细胞、动物或人体中的应用。
查阅计算机模拟研究时应注意的事项
- 与现实实验一样，使用计算机模拟方法进行的研究应具有可靠的方法论，详细说明所使用的确切软件和所采取的步骤。
- 最佳做法是提供尽可能多的可访问数据和代码，以便其他研究人员可以复制或在此基础上开展工作。
- 对计算机模拟研究的解释应该有分寸、有节制，作者应该承认需要进行后续的体外实验来验证其结论。
