Algorithms for Molecular Biology期刊介绍及投稿模板

Algorithms for Molecular Biology是生物信息学算法领域的开放获取期刊，聚焦RNA/蛋白质结构、基因预测、比较基因组学及机器学习，致力于发表新颖算法与方法。

BMC推荐AJE的论文润色等服务，您在向BMC旗下期刊提交稿件时，可以将AJE的润色证明一并提交给期刊。

期刊基本信息

期刊名称：Algorithms for Molecular Biology
主办单位：BioMed Central（Springer Nature旗下）
创刊年份：2006年
出版周期：持续出版（在线逐篇发布，无固定刊期）
国际标准刊号（ISSN）：1748-7188
影响因子/分区：

• Journal Impact Factor：1.7（2024年）
• 5年影响因子：1.5（2024年）
• SNIP：0.704（2024年）
• SJR：0.760（2024年）
• 中科院分区：4区（生物学-生化研究方法-生物工程与应用微生物-数学与计算生物学）

期刊定位与宗旨

定位：面向全球算法科学家、计算生物学家及AI专家，是分子生物学算法创新的国际平台。
宗旨：发表新颖算法与方法，涵盖结构分析、基因组学、系统发生学及机器学习，推动生物信息学前沿。

收录范围与主题

收录范围：

• Research Article：完整算法研究（6,000-10,000字）。
• Software Article：软件工具（需算法创新，3,000-6,000字）。
• Benchmarking：基准测试（需算法洞见）。

主题领域：

• RNA/蛋白质结构分析
• 基因预测与基因组分析
• 比较序列分析与比对
• 系统发生学与进化
• 基因表达与调控网络
• 组合算法与统计方法
• 机器学习与深度学习
• 网络分析与系统生物学

注意：不接受纯应用案例或工具增量改进。

编委会与编辑团队

编委会组成：

• 主编：未在官网明确公布，编辑团队由BMC专业人员管理。
• 客座编辑： WABI 2025 会议论文集 RECOMB-CG 专题
• 编委：由全球生物信息学算法领域的专家组成。

编辑团队：

• 由BioMed Central专业编辑支持，具备算法与生物信息学出版经验。

审稿流程与周期

审稿流程：

1. 初审：编辑评估算法新颖性（中位数12天）。
2. 外审：至少两位独立审稿人（双盲）。
3. 终审：编辑决定接受/修订/拒绝。
4. 修订：需提供代码与测试数据。

审稿周期：

• 初审：中位数12天（2024年数据）
• 投稿至接受：中位数104天（2024年数据）

投稿要求与指南

投稿要求：

• 文章长度：Research Article建议6,000-10,000字。
• 格式：BioMed Central模板，单栏，11号字，1.15倍行距。
• 图表：嵌入正文，高分辨率（≥300 DPI）。
  示例：
  Figure 1: RNA secondary structure prediction.
  a ViennaRNA fold (red: base pairs). b Accuracy vs. length.
• 公式：居中编号。
  示例：
  (1) E = \sum_{i<j} e(i,j) \cdot x_{ij}
• 表格：
  示例：
  Table 1: Alignment algorithm performance
• Tool Sensitivity Specificity Time (s) MAFFT 0.92 0.95 12.3 Ours 0.94 0.96 8.7
• 参考文献：Vancouver风格。
  示例：
  [1] Lorenz R, et al. ViennaRNA Package. Algorithms Mol Biol. 2025;20:12.
• 代码与数据：必须公开，GitHub/zenodo，提供DOI。
• Cover letter：说明算法创新与生物学意义。

投稿指南：

1. 注册Springer Nature系统。
2. 上传稿件、cover letter、代码链接。
3. 提供利益冲突声明。
4. 提交推荐审稿人。
5. 联系编辑部（algorithmsmolbiol@biomedcentral.com）。

出版质量与影响力

出版质量：

• 专业编辑、算法伪代码。

影响力：

• 数据库收录：PubMed、Scopus、Web of Science。
• 下载量：2024年235,471次。
• Altmetric：43次提及。

特色栏目与活动

特色栏目（开放投稿）：

• Machine Learning and AI for Sequence Analysis
• Selected Papers from WABI 2025

学术活动：

• 支持WABI会议论文集。
• 历史专题：RECOMB-CG、约束生物信息学。

读者服务与互动

读者服务：

• 开放获取，免费下载。
• 邮件/RSS订阅。

读者互动：

• 在线评论、读者来信（algorithmsmolbiol@biomedcentral.com）。
• @AlgoMolBio在X上分享研究。

联系方式与订阅信息

联系方式：

• 邮箱：algorithmsmolbiol@biomedcentral.com
• 地址：BioMed Central, London, UK

订阅信息：

• 开放获取，无需订阅。
• APC：2,590美元（2025年），低收入国家可减免。

最后

Algorithms for Molecular Biology作为生物信息学算法创新的全球平台，以其对结构预测、序列分析及AI方法的系统研究，引领计算生物学前沿。本指南基于官网信息，为作者提供从投稿到代码公开的全流程指导。建议投稿前请核对官网指南。