Applied and Environmental Microbiology期刊模板及作者指南

Applied and Environmental Microbiology（简称AEM）是应用微生物学和环境微生物学领域的顶尖期刊，以发表创新性、实用性强的研究而闻名。

AEM期刊推荐使用AJE的论文润色服务，AJE基于基于期刊官网的投稿指南，详尽解析论文结构、格式和投稿要求，为想投稿该期刊的小伙伴提供实用指导，助力论文顺利接受！

期刊主页：https://journals.asm.org/journal/aem
投稿指南：https://journals.asm.org/journal/aem/submit
投稿系统：https://asm.chronoshub.io/

期刊简介

AEM由American Society for Microbiology（ASM）出版，创刊于1953年，是应用与环境微生物学领域的旗舰期刊。期刊发表高质量的原创研究、综述和评论，涵盖环境微生物学、微生物生态、食品微生物学、工业微生物学、生物技术及公共健康微生物学，鼓励将基础研究应用于实际问题（如污染治理、食品安全）。文章需具科学深度和广泛影响力，适合微生物学、生态学及生物技术读者。期刊采用严格的同行评审，初审平均30-40天（官网数据）。

期刊相关信息：

• 影响因子：3.9（2023年）
• 中科院分区：2区（生物学-生物工程与应用微生物）-3区（微生物学）
• 出版费用：开放获取费用（APC）为3,500美元（非ASM会员，官网数据）；ASM会员享折扣。

投稿注意事项

• 文章长度：无严格字数限制，建议研究文章约5,000-8,000字（不含参考文献），需简洁明了。
• 投稿信：需提交，说明研究的意义、创新性及适合《AEM》的理由。
• 初始投稿格式：支持格式中立（Format Neutral），初稿无需严格遵循期刊格式，可用Word（.docx）或LaTeX，图表可嵌入或单独上传。
• 数据可用性：鼓励公开数据，建议存放在公共存储库（如figshare、Dryad）并提供DOI或URL。
• 代码可用性：使用自定义代码需提供代码清单，存放在公共存储库或作为补充材料。
• 预印本政策：接受在非营利预印本服务器（如bioRxiv）发布的稿件，需在投稿时声明。
• 快速审稿：初审平均30-40天，部分稿件可申请加速审稿（需说明理由）。
• 出版费用减免：无资助的研究可申请页面费用减免，投稿后联系生产编辑，提供稿件编号（如AEM00045-25）。
• 开放获取：可选择开放获取（APC 3,500美元，非会员）；非开放获取文章6个月后在ASM及PubMed Central免费公开。
• 补充材料费用：每件补充材料50美元（会员）或100美元（非会员）。
• 投稿限制：仅限一轮修订，拒绝后不可再次提交《AEM》或其他ASM期刊，除非编辑明确允许。

论文类型

《AEM》发表以下类型文章：

• Research Article：报告原创研究，包含引言、方法、结果、讨论等。
• Minireview：综述快速发展领域（≤6,000字，不含参考文献），需基于已发表数据，可由编辑邀请或作者提议。
• Commentary：讨论相关话题（≤4,000字，摘要75字），由编辑邀请。
• Letter to the Editor：新数据或评论（≤1,000字），新数据需付费。
• Spotlight：编辑精选的亮点文章，由编辑邀请，需快速发表。
• Retraction/Correction：更正或撤稿，需所有作者同意。

投稿需通过ASM ChronosHub提交，部分类型（如Commentary）需编辑邀请。

论文结构

一篇典型的Research Article包括以下部分，每部分附简短英文示例：

• 标题：简洁、描述性，避免缩写和冗长术语，最大15-20字。
  示例：
  Microbial degradation of plastic waste
• 作者信息：列出所有作者的姓名、单位、电子邮件及ORCID标识。
  示例：
  Department of Microbiology, University of California, Davis, CA, USA
  Anna Lee, Mark Chen
  School of Environmental Science, Yale University, New Haven, CT, USA
  Sarah Kim
• 贡献声明：明确每位共同作者的贡献，遵循ASM作者标准。
  示例：
  A.L. designed experiments; M.C. performed degradation assays; S.K. analyzed data and wrote the manuscript.
• 通信作者：指定通信作者，提供电子邮件及ORCID。
  示例：
  Correspondence to: Sarah Kim (sarah.kim@yale.edu)
• 摘要：概述背景、方法、结果和意义，最大250字，无参考文献。
  示例：
  Plastic pollution threatens ecosystems, yet microbial degradation offers a potential solution. We isolated Pseudomonas strains from plastic-contaminated soil and tested their polyethylene degradation efficiency. Strains degraded 15% of plastic mass in 60 days, with key enzymes identified via proteomics. These findings highlight microbial biotechnology for sustainable waste management.
• 关键词：提供3-8个关键词，便于检索。
  示例：
  plastic degradation, Pseudomonas, microbial biotechnology, polyethylene, waste management
• 引言：介绍研究背景、科学问题及目标，无子标题，需包含参考文献。
  示例：
  Plastic waste accumulates in ecosystems, posing environmental risks [1,2]. Microbial degradation is a promising bioremediation strategy [3]. This study characterizes Pseudomonas strains for polyethylene degradation, addressing gaps in enzyme identification.
• 结果：呈现研究发现，使用子标题，配以图表。
  示例：
  Degradation Efficiency
  Pseudomonas strain P1 degraded 15% of polyethylene mass in 60 days (n=10, P<0.01, t-test), outperforming strain P2 (8%) (figure 1a).
• 讨论：分析结果，阐述意义及与现有研究的关联，可使用子标题。
  示例：
  Our strains’ degradation efficiency surpasses reported rates for Bacillus [4]. Proteomic data suggest laccase-like enzymes drive degradation, offering targets for bioengineering sustainable plastics solutions.
• 方法：详细描述实验设计、数据分析及方法，确保可重复性，使用子标题。
  示例：
  Degradation Assays
  Pseudomonas strains were cultured on polyethylene films (0.1 mm) at 30°C for 60 days. Mass loss was measured gravimetrically. Proteomics used LC-MS/MS with UniProt database. Data were analyzed using ANOVA in R (v4.3.1).
• 统计信息：方法部分需包含统计分析描述，明确测试类型、P值等。
  示例：
  Two-tailed t-tests and ANOVA were used for degradation rates (n=10 samples). Error bars represent SD. For mass loss, t=4.8, d.f.=18, P<0.01; for enzyme activity, F=7.2, d.f.=2, P<0.05.
• 参考文献：列出所有引用文献（详见第6节）。
  示例：
  [1] Geyer R, et al. Appl Environ Microbiol. 2017;83:e01234-17.
• 致谢（可选）：简洁感谢资助机构或个人，包含资助编号。
  示例：
  Funded by NSF grant DEB-1234567. We thank UC Davis Genomics Core for support.
• 伦理声明：包括利益冲突和伦理合规声明。
  示例：
  Competing interests: The authors declare no competing interests.
  Ethics: No human or animal data; no ethical approval required.
• 数据可用性：提供数据存储库名称和访问编号。
  示例：
  Data available at figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.1234567
• 补充材料（可选）：提供额外数据、协议或视频。
  示例：
  Supplementary Table S1: Proteomic data for degradation enzymes.
  Supplementary Figure S1: SEM images of degraded polyethylene.

格式要求

《AEM》支持格式中立初稿，修订稿需遵循ASM格式指南。以下是具体要求：

字体和字号

• 正文：Times New Roman或Arial，11或12号字。
• 一级标题：粗体，12号字，首字母大写。
• 二级标题：粗体，11号字，首字母大写。
• 图表标题：粗体，10号字。

页面布局

• 使用 A4或Letter纸张。
• 页边距：上下左右各2.5厘米。
• 排版：单栏，双栏仅限出版。
• 行距：双倍行距（Word）或按LaTeX模板设置。

图表格式

• 图表嵌入正文或单独上传（初稿≤15MB/图），修订稿需提供高分辨率版本。
• 图表标题置于下方，Times New Roman，10号字，居中。
• 图表文字：8-10号字，确保清晰。
• 图表分辨率：至少300 DPI，RGB或CMYK，推荐格式为TIFF、JPEG或EPS。
• 颜色选择：支持彩色，建议高对比度（如蓝/黄），避免红绿。
• 图例：每幅图说明不超过500字。
• 版权：需获得受版权保护的图表许可，提交许可文件。
• 示例：
  Fig. 1: Polyethylene degradation.
  a Mass loss by Pseudomonas strains (blue: P1; red: P2). Error bars: SD (n=10). b Enzyme activity over time (n=5).

公式与术语

• 公式右对齐，括号编号，如 (1)，文中称为“equation (1)”。
• 微生物、基因名称遵循ASM及国际命名规范（如 Bergey’s Manual）。
• 示例：
  (1) dM/dt = kM

表格

• 表格置于正文末尾或单独文件，包含标题和图例。
• 大型表格（>50行或>10列）作为补充材料（如Excel）。

参考文献格式

《AEM》要求使用Vancouver引用风格，按文中出现顺序编号，文中以方括号引用（如 [1]）。参考文献需准确，优先引用期刊文章。以下是示例：

• 期刊文章：
  [1] Geyer R, Jambeck JR, Law KL. Production, use, and fate of plastics. Appl Environ Microbiol. 2017;83:e01234-17.
• 评论文章：
  [2] Chen M. Appl Environ Microbiol. 2023;89:e00045-23.
• 书籍：
  [3] Madigan MT, et al. Brock Biology of Microorganisms. 15th ed. Boston: Pearson; 2018.
• 数据集：
  [4] Lee A, Kim S. Plastic degradation dataset. figshare. https://doi.org/10.6084/m9.figshare.1234567 (2023).
• 预印本：
  [5] Chen M, Patel R. Microbial plastic degradation. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2023.01.15.123456 (2023).

伦理声明

• 利益冲突：需声明所有作者的利益冲突（如“无利益冲突”）。
• 伦理合规：涉及人类或动物的实验需遵循《赫尔辛基宣言》或动物伦理规范，提供伦理委员会批准编号。
• 数据可用性：需声明数据存储库及访问方式，或说明数据受限原因。
• 代码可用性：需提供代码存储库或补充材料。
• 示例：
  Competing interests: The authors declare no competing interests.
  Ethics: No human or animal data; no ethical approval required.
  Data availability: Data at figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.1234567.

补充材料

• 补充材料作为单独文件提交，格式为PDF、Excel、MP4（H.264编码，16:9）或ZIP。
• 包含大型表格、详细方法、代码、视频等，每件收费（50美元/会员，100美元/非会员）。
• 示例：
  Supplementary Table S1: Proteomic data for Pseudomonas enzymes.
  Supplementary Figure S1: SEM images of degraded polyethylene.

投稿流程

作者需通过ASM ChronosHub提交论文。流程如下：

• 注册并关联ORCID，指定通信作者（需符合ASM作者标准）。
• 上传Word/LaTeX稿件、投稿信、图表（≤15MB/图）及补充材料。
• 提供利益冲突声明、伦理声明、数据/代码可用性声明。
• 提交推荐审稿人（可选，3-5人，需提供姓名、邮箱及理由）。
• 在eJournalPress（eJP）系统中跟踪审稿状态，初审约30-40天。
• 修订稿需提交：修改稿（.docx，无痕迹）、审稿回复（逐点回应）、标记修改稿（显示痕迹）。
• 可联系编辑部（aem@asmusa.org）查询状态或申请费用减免。

最后

AJE希望为您的投稿提供坚实支持。建议投稿前仔细核对官网投稿指南，确保稿件符合要求。