BioData Mining期刊介绍及投稿模板

BioData Mining是生物信息学与AI领域的开放获取期刊，聚焦机器学习、视觉分析在基因组学、代谢组学、电子健康记录及社会-环境数据的知识发现，致力于推动精准医学与健康数据科学。

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期刊基本信息

期刊名称：BioData Mining
主办单位：BioMed Central（Springer Nature旗下）
创刊年份：2008年
出版周期：持续出版（在线逐篇发布，无固定刊期）
国际标准刊号（ISSN）：1756-0381
影响因子/分区：

• Journal Impact Factor：6.1（2024年）
• 5年影响因子：5.3（2024年）
• SNIP：1.570（2024年）
• SJR：1.068（2024年）
• 中科院分区：3区（生物学-数学与计算生物学）

期刊定位与宗旨

定位：面向全球数据科学家、生物信息学家、AI工程师及临床研究者，是生物医学大数据挖掘的国际权威平台。
宗旨：发表AI、机器学习、视觉分析在高维生物数据（基因组、代谢组、EHR、社会-环境暴露）的应用，强调计算方法创新与知识发现。

收录范围与主题

收录范围：

• Research Article：原创算法与应用（6,000-12,000字）。
• Methodology：新方法（4,000-8,000字）。
• Review：综述（6,000-12,000字）。
• Software Article：工具（需算法创新）。

主题领域：

• 机器学习（深度学习、强化学习）
• 视觉分析与交互式探索
• 基因组学与多组学整合
• 电子健康记录（EHR）挖掘
• 药物安全与不良反应预测
• 社会决定因素与环境暴露
• 因果推断与解释性AI

编委会与编辑团队

编委会组成：

• 主编： Jason H. Moore（现任） Nicholas P. Tatonetti（2025年起接任） Marylyn D. Ritchie（2022-2024）
• 客座编辑： Next-generation Machine Learning 系列
• 编委：由全球生物信息学、AI与医学领域的专家组成。

编辑团队：

• 由BioMed Central专业编辑支持，具备大数据与AI出版经验。

审稿流程与周期

审稿流程：

1. 初审：编辑评估算法创新与生物学意义（中位数10天）。
2. 外审：至少两位独立审稿人（双盲）。
3. 终审：主编决定接受/修订/拒绝。
4. 修订：需提供代码、数据与可重复性报告。

审稿周期：

• 初审：中位数10天（2024年数据）
• 投稿至接受：中位数137天（2024年数据）

投稿要求与指南

投稿要求：

• 文章长度：Research Article建议6,000-12,000字。
• 格式：BioMed Central模板，单栏，11号字，1.15倍行距。
• 图表：嵌入正文，高分辨率（≥300 DPI）。
  示例：
  Figure 1: Deep learning for drug interaction prediction.
  a Model architecture (CNN + GNN). b ROC curve (AUC = 0.94).
• 公式：居中编号。
  示例：
  (1) \hat{y} = \sigma(W_2 \cdot \text{ReLU}(W_1 \cdot x + b_1) + b_2)
• 表格：
  示例：
  Table 1: Feature importance in EHR model
• Feature SHAP Value p-value HbA1c 0.42 <0.001 BMI 0.28 0.002 Social Deprivation 0.15 0.01
• 参考文献：Vancouver风格。
  示例：
  [1] Tatonetti NP, et al. Data-driven prediction. BioData Mining. 2025;18:12.
• 代码与数据：必须公开，GitHub/zenodo，提供DOI与可重复性声明。
• Cover letter：说明算法创新与生物医学影响。

投稿指南：

1. 注册Springer Nature系统。
2. 上传稿件、cover letter、代码链接。
3. 提供利益冲突声明。
4. 提交推荐审稿人。
5. 联系编辑部（biodatamining@biomedcentral.com）。

出版质量与影响力

出版质量：

• 专业编辑、交互式图表与代码仓库。

影响力：

• 数据库收录：PubMed、Scopus、Web of Science。
• 下载量：2024年358,709次。
• Altmetric：110次提及。

特色栏目与活动

特色栏目（开放投稿）：

• Advances in Data Mining for Biomedical Informatics and Healthcare
• Next-generation Machine Learning（Jason Moore、Nicholas Tatonetti 主编）

学术活动：

• 播客：Biomedical Informatics Roundtable（主编主持）。
• 新主编上任（2025）。

读者服务与互动

读者服务：

• 开放获取，免费下载。
• 邮件/RSS订阅。

读者互动：

• 在线评论、读者来信（biodatamining@biomedcentral.com）。
• @BioDataMining在X上分享研究。

联系方式与订阅信息

联系方式：

• 邮箱：biodatamining@biomedcentral.com
• 地址：BioMed Central, London, UK

订阅信息：

• 开放获取，无需订阅。
• APC：2,890美元（2025年），低收入国家可减免。

最后

BioData Mining作为生物医学大数据挖掘的全球AI平台，以其对机器学习、EHR与多组学的系统研究，引领精准医学数据科学。本指南基于期刊官网，系统解析了期刊信息、投稿要求及出版流程，为数据科学家、生物信息学家及临床研究者提供实用支持。投稿请使用BioMed Central模板。