BMC Bioinformatics期刊介绍及投稿模板

BMC Bioinformatics是生物信息学领域的开放获取期刊，聚焦算法、软件、模型与AI在基因组学、蛋白质组学、系统生物学等大数据分析中的应用，致力于推动计算方法创新。本指南基于期刊官网（Home page | BMC Bioinformatics），系统解析了期刊信息、投稿要求及出版流程，为算法科学家、生物信息学家及AI研究者提供帮助，共同引领生物医学计算革命。

BMC推荐AJE的论文润色等服务，您在向BMC旗下期刊提交稿件时，可以将AJE的润色证明一并提交给期刊。

期刊基本信息

期刊名称：BMC Bioinformatics
主办单位：BioMed Central（Springer Nature旗下）
创刊年份：2000年
出版周期：持续出版（在线逐篇发布，无固定刊期）
国际标准刊号（ISSN）：1471-2105
影响因子/分区：

• Journal Impact Factor：3.3（2024年）
• 5年影响因子：3.5（2024年）
• SNIP：1.024（2024年）
• SJR：1.190（2024年）
• 中科院分区：4区（生物学-生化研究方法-数学与计算生物学），3区（生物工程与应用微生物）

期刊定位与宗旨

定位：面向全球生物信息学家、算法科学家及AI专家，是生物信息学计算方法的国际权威平台。
宗旨：发表新颖算法、软件、模型与工具，涵盖复杂系统、比较基因组学、图像分析、机器学习、网络分析等，推动生物大数据的建模与分析。

收录范围与主题

收录范围：

• Research Article：算法与应用（6,000-10,000字）。
• Software Article：软件工具（3,000-6,000字）。
• Methodology：方法创新（4,000-8,000字）。
• Database：数据库（需算法创新）。

主题领域：

• 复杂系统建模
• 比较基因组学
• 数据可视化
• 生物图像分析
• 知识驱动分析
• 机器学习与AI
• 网络分析
• 蛋白质组学
• 序列分析
• 结构分析
• 转录组分析

注意：不以“影响力”拒稿，仅看科学严谨性与方法新颖性。

编委会与编辑团队

编委会组成：

• 主编：未在官网明确公布，编辑团队由BMC专业人员管理。
• 客座编辑： Rafi Ahmad、Christina Boucher（抗菌素耐药性平台） George M Spyrou、Vetrivel Umashankar（药物发现） Stefano Lonardi、Oluwatosin Oluwadare（3D基因组学）
• 编委招募中：欢迎全球生物信息学专家申请。

编辑团队：

• 由BioMed Central专业编辑支持，具备算法与工具出版经验。

审稿流程与周期

审稿流程：

1. 初审：编辑评估算法新颖性（中位数5天）。
2. 外审：至少两位独立审稿人（双盲）。
3. 终审：主编决定接受/修订/拒绝。
4. 修订：需提供代码、测试数据与可重复性报告。

审稿周期：

• 初审：中位数5天（2024iske数据）
• 投稿至接受：中位数145天（2024年数据）

投稿要求与指南

投稿要求：

• 文章长度：Research Article建议6,000-10,000字。
• 格式：BioMed Central模板，单栏，11号字，1.15倍行距。
• 图表：嵌入正文，高分辨率（≥300 DPI）。
  示例：
  Figure 1: AMR detection pipeline.
  a Workflow. b ROC curve (AUC = 0.97).
• 公式：居中编号。
  示例：
  (1) P(k) = \frac{\langle k^2 \rangle}{\langle k \rangle} e^{-k/\langle k \rangle}
• 表格：
  示例：
  Table 1: Tool comparison
• Tool Sensitivity Specificity Runtime (s) BLAST 0.88 0.92 120 Ours 0.95 0.96 45
• 参考文献：Vancouver风格。
  示例：
  [1] Ahmad R, et al. AMR platform. BMC Bioinformatics. 2025;26:12.
• 代码与数据：必须公开，GitHub/zenodo，提供DOI与安装指南。
• Cover letter：说明算法创新与生物学意义。

投稿指南：

1. 注册Springer Nature系统。
2. 上传稿件、cover letter、代码链接。
3. 提供利益冲突声明。
4. 提交推荐审稿人。
5. 联系编辑部（bmcbioinformatics@biomedcentral.com）。

出版质量与影响力

出版质量：

• 专业编辑、交互式代码与可视化。

影响力：

• 数据库收录：PubMed、Scopus、Web of Science。
• 下载量：2024年7,556,602次。
• Altmetric：2,739次提及。

特色栏目与活动

特色栏目（开放投稿）：

• Bioinformatics platforms for AMR
• Bioinformatics and chemoinformatics in drug discovery
• 3D genomics

学术活动：

• 编委招募中。
• Peer Review Week博客。

读者服务与互动

读者服务：

• 开放获取，免费下载。
• 邮件/RSS订阅。

读者互动：

• 在线评论、读者来信（bmcbioinformatics@biomedcentral.com）。
• @BMCBioinfo在X上分享研究。

联系方式与订阅信息

联系方式：

• 邮箱：bmcbioinformatics@biomedcentral.com
• 地址：BioMed Central, London, UK

订阅信息：

• 开放获取，无需订阅。
• APC：2,890美元（2025年），低收入国家可减免。

最后

BMC Bioinformatics是生物信息学算法与工具的全球平台，以其对AI、3D基因组学及药物发现的系统研究，引领计算生物学前沿。本指南基于官网信息，为作者提供从投稿到代码公开的全流程指导。投稿请使用BioMed Central模板。