Journal of Cheminformatics是化学信息学领域的开放获取期刊，致力于发表化学信息学及分子建模的原创同行评议研究，促进分子科学与计算技术的融合。
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期刊基本信息
期刊名称：Journal of Cheminformatics
主办单位：BioMed Central（Springer Nature旗下）
创刊年份：2009年
出版周期：持续出版（在线逐篇发布，无固定刊期）
国际标准刊号（ISSN）：1758-2946
影响因子/分区：5.7（2024年），中科院2区（化学-化学：综合），中科院2区（计算机：信息系统-计算机：跨学科应用）
期刊定位与宗旨
定位：面向全球化学信息学家、分子建模专家及计算化学研究者，是化学信息学与分子建模的国际权威期刊。
宗旨：致力于发表化学信息学及分子建模的所有方面原创同行评议研究，提供科学家交流发现的平台，促进化学科学与计算技术的整合。
收录范围与主题
收录范围：
- Research Article：完整研究文章（6,000-10,000字），报告化学信息学的原创研究。
- Review：综述专题（6,000-12,000字），需具广泛参考价值，通常由编辑邀请。
- Short Report：简短研究报告（≤3,000字），聚焦初步结果或新技术。
- Letter：简短通信（≤1,500字），讨论研究或热点问题。
- Methodology：技术方法文章（3,000-6,000字），介绍新算法或软件工具。
主题领域：
- 化学信息学算法与方法
- 分子建模与模拟
- 大数据与AI在化学中的应用
- 分子数据库与信息检索
- 药物发现与虚拟筛选
- 化学结构-活性关系（QSAR）
- 计算毒理学及环境化学
- 化学软件开发与工具
编委会与编辑团队
编委会组成：
- 主编：Rajarshi Guha（美国，化学信息学专家）；Egon Willighagen（荷兰，马斯特里赫特大学，开放科学与化学信息学专家）。
- 编委：由全球化学信息学、计算化学及分子建模领域的资深学者组成，覆盖大数据、AI应用及软件开发。
编辑团队：
- 由BioMed Central专业编辑团队支持，具备化学及计算科学出版经验，负责稿件初筛、审稿协调及出版流程管理，确保稿件的高质量。
审稿流程与周期
审稿流程：
- 初审：编辑团队评估稿件格式、完整性及与期刊定位的匹配度（约1-3天）。
- 外审：稿件送至至少两位独立审稿人（双盲评审），评估科学严谨性、创新性及计算方法可靠性。
- 终审：主编综合审稿意见决定接受、修订或拒绝。
- 修订：通常允许一轮主要修订，需逐点回应审稿意见。
审稿周期：
- 初审：约9天（官网数据，2024年）。
- 投稿至接受：约131天（官网数据，2024年）。
投稿要求与指南
投稿要求：
- 文章长度：Research Article建议6,000-10,000字，Review 6,000-12,000字，其他类型见第3节。
- 格式：使用BioMed Central模板（Word或LaTeX），单栏，Arial或Times New Roman，11号字，1.15倍行距。
- 图表：嵌入正文，修订稿需单独上传高分辨率文件（≥300 DPI，TIFF/JPEG/PNG）。图表标题置于下方，10号字，图例≤300字。
示例：
Figure 1: QSAR model for drug candidates.
a Predicted vs. experimental activity (blue: training set; red: test set). b Variable importance plot. - 公式：居中，右对齐编号，如 (1），文中称为“equation (1)”。
示例：
(1) A = k \log P + \sigma - 表格：嵌入正文，标题置于上方，10号字，大型表格作为补充材料。
示例：
Table 1: Molecular descriptors - Descriptor Value (Mean ± SD) Correlation (r) LogP 3.5 ± 0.4 0.85 Molecular Weight 300 ± 50 0.62 Data from 100 compounds.
- 参考文献：Vancouver风格，文中以方括号引用（如 [1]）。
示例：
[1] Guha R, et al. AI in cheminformatics. J Cheminform. 2024;16:123. - 数据可用性：需公开数据，存放在figshare、Dryad或Zenodo，提供DOI。
示例：
Data at Zenodo: https://doi.org/10.5281/zenodo.123456 - 代码可用性：涉及软件/算法的需提供代码（如GitHub）。
示例：
Code at GitHub: https://github.com/CheminformaticsTools - 伦理声明：涉及人类/动物的需提供伦理批准编号。
示例：
Ethics approval: Not applicable. - Cover letter：说明研究创新性及对化学信息学的贡献。
- 语言：高标准英语，建议AJE润色。
- 预投稿咨询：通过jcheminf@biomedcentral.com提交标题及摘要，主题注明“Submission Inquiry”。
投稿指南：
- 注册Springer Nature系统并关联ORCID。
- 上传稿件、cover letter、图表、补充材料。
- 提供利益冲突、数据/伦理声明。
- 选择“In Review”服务（可选）。
- 提交推荐审稿人（2-3人）。
- 跟踪状态，提交修订稿。
- 联系编辑部（jcheminf@biomedcentral.com）查询或申请APC减免。
出版质量与影响力
出版质量：
- 专业编辑、校对，高分辨率图表（彩色免费）。
- XML/PDF/HTML格式。
影响力：
- 数据库收录：PubMed、Scopus、Web of Science、DOAJ等。
- 引用与下载：2024年下载1,615,511次，Altmetric提及886次。
- 学术影响：JIF 5.7，5年JIF 8.9，SNIP 1.792，SJR 1.570。
- 认可：Springer Nature化学期刊，文章被药物发现、材料科学广泛引用。
特色栏目与活动
特色栏目：
- Evaluating AI and Machine Learning Models in Cheminformatics（开放投稿）。
- From Molecules to Data: The Emerging Impact of Chemoinformatics in Chemistry（开放投稿）。
- Milestones in Cheminformatics（15周年纪念，综述历史里程碑）。
学术活动：
- 支持Springer Nature化学系列，促进跨学科交流。
- 提供“In Review”服务，促进审稿透明。
- 组织“Cheminformatics Forum”等线上活动。
读者服务与互动
读者服务：
- 开放获取，免费下载。
- 邮件/RSS订阅。
读者互动：
- 在线评论、读者来信（jcheminf@biomedcentral.com）。
- @JCheminform在X上分享亮点。
- “In Review”平台公开审稿。
联系方式与订阅信息
联系方式：
- 邮箱：jcheminf@biomedcentral.com
- 预投稿咨询：jcheminf@biomedcentral.com（主题注明“Submission Inquiry”）。
- 地址：BioMed Central, London, UK
订阅信息：
- 开放获取，无需订阅。
- APC：2,790美元（2025年），低收入国家可减免。
- 优惠：机构会员折扣。
最后
Journal of Cheminformatics作为化学信息学的学术期刊，以其对计算方法与分子研究的深度整合引领化学科学的数字化转型。本指南基于官网信息，揭示分子世界的计算奥秘。请使用BioMed Central模板投稿，期待您的成果早日发表。
