
Microbiology Spectrum(简称《Spectrum》)是微生物学领域的高质量开放获取期刊,致力于发表涵盖微生物学全谱的创新研究,从基础科学到应用技术,连接学术与实践。投稿需突出研究的科学深度、广泛吸引力及潜在影响力,并遵循清晰的格式规范。
Microbiology Spectrum推荐AJE的论文润色服务,如您使用AJE的论文润色服务,可以在投稿期刊时,将AJE润色证明连同稿件一并提交给期刊。
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期刊主页:https://journals.asm.org/journal/spectrum
投稿指南:https://journals.asm.org/journal/spectrum/submit
投稿系统:https://asm.chronoshub.io/
期刊简介
《Spectrum》由American Society for Microbiology(ASM)出版,创刊于2021年,是微生物学领域的开放获取期刊,覆盖细菌学、病毒学、真菌学、寄生虫学、微生物生态学、病原性、抗菌研究及生物技术。期刊发表原创研究、综述、方法类文章及评论,鼓励跨学科研究和具有转化潜力的工作。文章需具科学严谨性和广泛影响力,适合微生物学家、生物技术研究者及公共卫生专家。期刊采用严格的同行评审,初审平均30-40天(官网数据)。
期刊相关信息:
- 影响因子:3.7(2023年)
- 中科院分区:2区(生物学)-3区(微生物学)
- 出版费用:开放获取费用(APC)为3,500美元(非ASM会员,官网数据);ASM会员享折扣。
投稿注意事项
- 文章长度:研究文章无严格字数限制,建议5,000-8,000字(不含参考文献);方法类文章或简讯限3,000字,参考文献≤30条。
- 投稿信:需提交,说明研究的科学意义、创新性、广泛吸引力及适合《Spectrum》的理由。
- 初始投稿格式:支持格式中立(Format Neutral),初稿无需严格遵循期刊格式,可用Word(.docx)或LaTeX,图表可嵌入或单独上传。
- 数据可用性:要求公开数据,需存放在公共存储库(如figshare、Dryad、NCBI)并提供DOI或URL。
- 代码可用性:使用自定义代码需提供代码清单,存放在公共存储库(如GitHub)或作为补充材料。
- 预印本政策:接受在非营利预印本服务器(如bioRxiv)发布的稿件,需在投稿时声明。
- 快速审稿:初审平均30-40天,部分稿件可申请加速审稿(需说明理由)。
- 出版费用减免:无资助的研究可申请APC减免,投稿后联系生产编辑,提供稿件编号(如SPECTRUM00012-25)。
- 开放获取:所有文章均为开放获取,出版后立即免费公开。
- 补充材料费用:每件补充材料50美元(会员)或100美元(非会员)。
- 投稿限制:仅限一轮修订,拒绝后不可再次提交《Spectrum》或其他ASM期刊,除非编辑明确允许。
论文类型
《Spectrum》发表以下类型文章:
- Research Article:报告原创研究,包含引言、方法、结果、讨论等。
- Method:描述新方法或技术(≤3,000字,参考文献≤30条),需具可重复性。
- Brief Report:简短研究报告(≤3,000字,参考文献≤30条),聚焦新颖发现。
- Minireview:综述快速发展领域(≤6,000字,不含参考文献),需具广泛吸引力,可由编辑邀请或作者提议。
- Commentary:讨论热点话题(≤4,000字,摘要75字),由编辑邀请。
- Letter to the Editor:新数据或评论(≤1,000字),新数据需付费。
- Retraction/Correction:更正或撤稿,需所有作者同意。
投稿需通过ASM ChronosHub提交,部分类型(如Commentary)需编辑邀请。
论文结构
一篇典型的Research Article包括以下部分,每部分附简短英文示例:
- 标题:简洁、描述性,避免缩写,突出研究主题,最大15-20字。
示例:
Antibiotic resistance in soil bacteria - 作者信息:列出所有作者的姓名、单位、电子邮件及ORCID标识。
示例:
Department of Microbiology, University of California, Davis, CA, USA
Emma Liu, Noah Carter
Institute of Environmental Science, Stanford University, Stanford, CA, USA
Olivia Kim - 贡献声明:明确每位共同作者的贡献,遵循ASM作者标准。
示例:
E.L. designed experiments; N.C. performed sequencing; O.K. analyzed data and wrote the manuscript. - 通信作者:指定通信作者,提供电子邮件及ORCID。
示例:
Correspondence to: Olivia Kim (olivia.kim@stanford.edu) - 摘要:概述背景、方法、结果和意义,最大250字,无参考文献。
示例:
Soil bacteria are a reservoir for antibiotic resistance genes (ARGs). We sequenced 100 soil isolates, identifying 50 novel ARGs conferring resistance to tetracycline. Functional assays confirmed resistance in 80% of isolates. Data are available at GenBank (PRJNA123456). These findings highlight soil as a critical ARG source. - 关键词:提供3-8个关键词,便于检索。
示例:
antibiotic resistance, soil bacteria, ARGs, metagenomics, tetracycline - 引言:介绍研究背景、科学问题及目标,无子标题,需包含参考文献。
示例:
Antibiotic resistance genes (ARGs) in soil bacteria threaten public health [1,2]. Their diversity and function remain underexplored [3]. This study characterizes novel ARGs in agricultural soil isolates. - 结果:呈现研究发现,使用子标题,配以图表。
示例:
ARG Diversity
Sequencing revealed 50 novel ARGs in 100 isolates, with 80% conferring tetracycline resistance (n=5, P<0.01, chi-square) (figure 1). - 讨论:分析结果,阐述意义及与现有研究的关联,可使用子标题。
示例:
Environmental Implications
Our findings expand known ARG diversity [4]. Soil management strategies could reduce ARG dissemination. - 方法:详细描述实验设计、数据分析及方法,确保可重复性,使用子标题。
示例:
Metagenomic Sequencing
Soil samples (n=100) from California farms were sequenced using Illumina NovaSeq. ARGs were annotated with ResFinder. Resistance was validated by disk diffusion assays. Data were analyzed using chi-square tests in R (v4.3.1). - 统计信息:方法部分需包含统计分析描述,明确测试类型、P值等。
示例:
Chi-square tests were used for ARG prevalence (n=100 isolates). Error bars represent 95% CI. For tetracycline resistance, χ²=25.6, d.f.=1, P<0.01. - 参考文献:列出所有引用文献(详见第6节)。
示例:
[1] Allen HK, et al. Microbiol Spectrum. 2022;10:e01234-22. - 致谢(可选):简洁感谢资助机构或个人,包含资助编号。
示例:
Funded by NSF grant DEB-1234567. We thank the UC Davis Sequencing Core. - 伦理声明:包括利益冲突和伦理合规声明。
示例:
Competing interests: The authors declare no competing interests.
Ethics: No human or animal data; no ethical approval required. - 数据可用性:提供数据存储库名称和访问编号。
示例:
Data available at GenBank: BioProject PRJNA123456. - 补充材料(可选):提供额外数据、协议或视频。
示例:
Supplementary Table S1: ARG annotation details.
Supplementary Figure S1: Resistance assay results.
格式要求
《Spectrum》支持格式中立初稿,修订稿需遵循ASM格式指南。以下是具体要求:
字体和字号
- 正文:Times New Roman或Arial,11或12号字。
- 一级标题:粗体,12号字,首字母大写。
- 二级标题:粗体,11号字,首字母大写。
- 图表标题:粗体,10号字。
页面布局
- 使用 A4或Letter纸张。
- 页边距:上下左右各2.5厘米。
- 排版:单栏,双栏仅限出版。
- 行距:双倍行距(Word)或按LaTeX模板设置。
图表格式
- 图表嵌入正文或单独上传(初稿≤15MB/图),修订稿需提供高分辨率版本。
- 图表标题置于下方,Times New Roman,10号字,居中。
- 图表文字:8-10号字,确保清晰。
- 图表分辨率:至少300 DPI,RGB或CMYK,推荐格式为TIFF、JPEG或EPS。
- 颜色选择:支持彩色,建议高对比度(如蓝/黄),避免红绿。
- 图例:每幅图说明不超过500字。
- 版权:需获得受版权保护的图表许可,提交许可文件。
- 示例:
Fig. 1: ARG distribution.
a Prevalence of tetracycline ARGs (blue: novel; red: known). Error bars: 95% CI (n=100). b Soil sampling sites.
公式与术语
- 公式右对齐,括号编号,如 (1),文中称为“equation (1)”。
- 微生物、基因名称遵循ASM及国际命名规范(如 Bergey’s Manual、HGNC)。
- 示例:
(1) R = β0 + β1G
表格
- 表格置于正文末尾或单独文件,包含标题和图例。
- 大型表格(>50行或>10列)作为补充材料(如Excel)。
参考文献格式
《Spectrum》要求使用Vancouver引用风格,按文中出现顺序编号,文中以方括号引用(如 [1])。参考文献需准确,优先引用期刊文章。以下是示例:
- 期刊文章:
[1] Allen HK, Donato J. Soil resistome. Microbiol Spectrum. 2022;10:e01234-22. - 评论文章:
[2] Carter N. Microbiol Spectrum. 2023;11:e00078-23. - 书籍:
[3] Madigan MT, et al. Brock Biology of Microorganisms. 16th ed. Boston: Pearson; 2021. - 数据集:
[4] Liu E, Kim O. Soil ARG dataset. GenBank. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA123456 (2023). - 预印本:
[5] Kim O, Carter N. Soil metagenomics. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2023.01.15.123456 (2023).
伦理声明
- 利益冲突:需声明所有作者的利益冲突(如“无利益冲突”)。
- 伦理合规:涉及人类或动物的实验需遵循《赫尔辛基宣言》或动物伦理规范,提供伦理委员会批准编号。
- 数据可用性:需声明数据存储库及访问方式。
- 代码可用性:需提供代码存储库或补充材料。
- 示例:
Competing interests: The authors declare no competing interests.
Ethics: No human or animal data; no ethical approval required.
Data availability: Data at GenBank: BioProject PRJNA123456.
补充材料
- 补充材料作为单独文件提交,格式为PDF、Excel、MP4(H.264编码,16:9)或ZIP。
- 包含大型表格、详细方法、代码、视频等,每件收费(50美元/会员,100美元/非会员)。
- 示例:
Supplementary Table S1: Raw sequencing data.
Supplementary Figure S1: Phylogenetic tree of ARGs.
投稿流程
作者需通过ASM ChronosHub提交论文。流程如下:
- 注册并关联ORCID,指定通信作者(需符合ASM作者标准)。
- 上传Word/LaTeX稿件、投稿信、图表(≤15MB/图)及补充材料。
- 提供利益冲突声明、伦理声明、数据/代码可用性声明。
- 提交推荐审稿人(可选,3-5人,需提供姓名、邮箱及理由)。
- 在eJournalPress(eJP)系统中跟踪审稿状态,初审约30-40天。
- 修订稿需提交:修改稿(.docx,无痕迹)、审稿回复(逐点回应)、标记修改稿(显示痕迹)。
- 可联系编辑部(spectrum@asmusa.org)查询状态或申请APC减免。
最后
Microbiology Spectrum以其广谱的微生物学视野和开放获取模式,为全球研究者提供了一个展示创新成果的动态平台。我们希望本文为您的投稿提供支持。建议投稿前仔细核对官网投稿指南及格式指南,确保稿件精益求精。