Microbiome期刊模板及指南

Microbiome是微生物群研究领域的期刊，致力于探索微生物群在人类、动物、植物及环境中的功能机制，推动多组学技术和因果关系研究的科学进步。本指南基于期刊官网，系统解析了期刊信息、投稿要求及出版流程，为微生物群研究领域的学者提供实用支持，助力打造高水平学术文章，共同揭开微生物群与宿主及环境交互的奥秘。

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期刊基本信息

期刊名称：Microbiome
主办单位：BioMed Central（Springer Nature旗下）
创刊年份：2013年
出版周期：持续出版（在线逐篇发布，无固定刊期）
国际标准刊号（ISSN）：2049-2618
影响因子/分区：12.7（2024年），属于中科院1区（生物学-微生物学）

期刊定位与宗旨

定位：面向全球微生物群研究领域的科学家、生物信息学家、生态学家及临床研究者，是微生物群机制研究的国际权威期刊。
宗旨：致力于发表微生物群与宿主或环境交互的机制研究，强调多组学方法、因果关系及技术创新，推动微生物生态学及相关领域的科学进步。

收录范围与主题

收录范围：

• Research Article：完整研究文章（6,000-10,000字），报告微生物群的机制研究或技术创新。
• Short Report：简短研究报告（≤3,000字），聚焦初步结果或新技术。
• Review：综述专题（6,000-12,000字），需具广泛参考价值，通常由编辑邀请。
• Commentary：热点问题评论（≤2,000字），需编辑批准。
• Methodology Article：新方法或工具（4,000-6,000字），需具可重复性。
• Letter：简短通信（≤1,500字），讨论研究或技术问题。

主题领域：

• 人类、动物、植物及环境微生物群
• 多组学（宏基因组、转录组、代谢组等）
• 微生物群与宿主交互的结构-功能关系
• 微生物群在健康、疾病及环境中的机制
• 生物信息学工具开发
• 农业、极端环境及建成环境的微生物群

注：不接受仅描述性组学研究或单一菌株的体外/体内研究，需揭示机制或因果关系。

编委会与编辑团队

编委会组成：

• 主编：Jacques Ravel（美国，马里兰大学，微生物群与人类健康专家）、Elizabeth Wellington（英国，华威大学，环境微生物学专家）。
• 副主编：多名，来自全球顶尖机构（如哈佛大学、EMBL），涵盖微生物生态学、多组学、生物信息学等领域。
• 编委：由全球微生物群研究领域的资深学者组成，覆盖人类健康、植物微生物群、环境微生物学及生物技术。

编辑团队：

• 由BioMed Central专业编辑团队支持，具备微生物学及生物医学出版经验，负责稿件初筛、审稿协调及出版流程管理，确保稿件的高标准。

审稿流程与周期

审稿流程：

1. 初审：编辑团队评估稿件格式、完整性及与期刊定位的匹配度（约1-3天），需符合机制研究或技术创新要求。
2. 外审：稿件送至至少两位独立审稿人（双盲评审），评估科学严谨性、创新性及机制深度。
3. 终审：主编综合审稿意见决定接受、修订或拒绝。
4. 修订：通常允许一轮主要修订，需明确回应审稿意见。

审稿周期：

• 初审：约22天（官网数据，2024年）。
• 投稿至接受：约176天（官网数据，2024年）。

投稿要求与指南

投稿要求：

• 文章长度：Research Article建议6,000-10,000字，其他类型见第3节。
• 格式：使用BioMed Central模板（Word或LaTeX），单栏，Arial或Times New Roman，11号字，1.15倍行距。
• 图表：嵌入正文，修订稿需单独上传高分辨率文件（≥300 DPI，TIFF/JPEG/PNG）。图表标题置于下方，10号字，图例≤300字。
  示例：
  Figure 1: Gut microbiome diversity.
  a Alpha diversity vs. diet (blue: high-fiber; red: control). b Beta diversity (PCoA).
• 公式：居中，右对齐编号，如 (1)，文中称为“equation (1)”。
  示例：
  (1) D = α(t) + β(m)
• 表格：嵌入正文，标题置于上方，10号字，大型表格作为补充材料。
  示例：
  Table 1: Microbiome composition
• Group Shannon Index Firmicutes (%) High-fiber 4.5 ± 0.2 60 ± 5 Control 3.8 ± 0.3 45 ± 6 Data from 100 subjects.
• 参考文献：Vancouver风格，文中以方括号引用（如 [1]）。
  示例：
  [1] Smith J, Doe A, et al. Gut microbiome and diet. Microbiome. 2024;12:123.
• 数据可用性：需公开数据，存放在figshare、Dryad或Zenodo，提供DOI。
  示例：
  Data at Zenodo: https://doi.org/10.5281/zenodo.123456
• 代码可用性：涉及分析的需提供代码（如GitHub）。
  示例：
  Code at GitHub: https://github.com/GutMicrobiome
• 伦理声明：涉及人类/动物的需提供伦理批准编号，遵循《赫尔辛基宣言》或动物伦理指南。
  示例：
  Ethics approval: Approved by IRB-2023-001.
• Cover letter：说明研究创新性、机制深度及对微生物群领域的贡献。
• 语言：需高标准英语，建议使用AJE或Springer Nature Editing Service润色。

投稿指南：

1. 注册Springer Nature Submission System并关联ORCID。
2. 上传稿件（Word/PDF）、cover letter、图表及补充材料。
3. 提供利益冲突、数据/代码可用性及伦理声明。
4. 选择“In Review”服务（可选），审稿期间公开稿件并获DOI。
5. 提交推荐审稿人（可选，2-3人，提供姓名、邮箱及理由）。
6. 跟踪审稿状态，提交修订稿及逐点回复。
7. 联系编辑部（microbiome@biomedcentral.com）查询或申请APC减免。

出版质量与影响力

出版质量：

• 由BioMed Central专业团队编辑、校对，确保语言准确、排版规范。
• 图表高分辨率，支持彩色，无额外费用。
• 提供XML、PDF及HTML格式，支持Video Bytes（1-2分钟视频摘要，免费）。

影响力：

• 数据库收录：PubMed、Scopus、Web of Science、DOAJ等。
• 引用与下载：2024年下载量超389万次，Altmetric提及5,458次（官网数据）。
• 学术影响：SNIP 2.711，SJR 4.117（2024年，官网数据），在微生物学领域位居前列。
• 认可：Video Bytes提升文章浏览量168%、引用143%、Altmetric得分161%（官网数据）。

特色栏目与活动

特色栏目：

• Microbiome and Reproductive Health：探索微生物群与生殖健康机制（开放至2026年6月16日）。
• Harnessing Plant Microbiomes：跨刊物专题，研究植物微生物群功能（开放至2026年6月1日）。
• Thematic Series：如“Microbiota-Gut-Brain Axis”、“Antimicrobial Resistance and the Microbiome”。
• Cross Journal Collections：如“Food Security and Sustainability”、“Engineering Microbiomes for Green Technologies”。

学术活动：

• 组织线上研讨会，如“Microbiome and Health”论坛。
• 支持国际会议，如“International Congress of Microbiology”。
• 提供“In Review”服务，促进审稿期间学术交流。
• 发布Video Bytes，增强研究可理解性及传播力。

读者服务与互动

读者服务：

• 电子版下载：所有文章开放获取，PDF/HTML免费下载。
• 邮件订阅：通过BioMed Central订阅最新文章及动态。
• RSS推送：实时更新新文章。
• Video Bytes：每篇接受文章获免费1-2分钟视频摘要，发布于期刊网站及Research Square。

读者互动：

• 鼓励在线评论及读者来信（microbiome@biomedcentral.com）。
• 支持社交媒体互动，@Microbiome在X上分享研究亮点。
• 通过“In Review”平台，读者可评论审稿中稿件。

联系方式与订阅信息

联系方式：

• 邮箱：microbiome@biomedcentral.com
• 在线客服：通过Springer Nature网站（https://www.springernature.com）联系。
• 编辑部地址：BioMed Central, The Campus, 4 Crinan Street, London, N1 9XW, UK

订阅信息：

• 作为开放获取期刊，无需订阅，所有文章免费访问。
• APC：2,970美元（2025年，官网数据），低收入国家作者可申请减免。
• 优惠活动：机构会员（如Springer Nature会员计划）可享受APC折扣。

最后

Microbiome作为微生物群研究的学术期刊，以其对机制和多组学的深入探索引领生物学与生态学的交叉前沿。本指南基于官网信息，详细解析了期刊定位、投稿要求及出版流程，为作者提供了从格式到审稿的全面支持。请使用BioMed Central模板，祝您投稿顺利！