Nature Methods论文格式模板

Nature Methods由Nature Portfolio主办,是方法学领域的期刊,致力于发表推动生物学及相关领域技术进步的高影响力方法开发、优化及应用研究,涵盖拉曼成像、空间蛋白质组学、人工智能(AI)在生物学中的应用等领域。期刊强调方法的创新性、普适性及对科学研究的推动作用,鼓励跨学科技术开发以应对复杂生物学问题。

更新于2025年8月28日

Nature Methods

Nature Methods由Nature Portfolio主办,是方法学领域的期刊,致力于发表推动生物学及相关领域技术进步的高影响力方法开发、优化及应用研究,涵盖拉曼成像、空间蛋白质组学、人工智能(AI)在生物学中的应用等领域。期刊强调方法的创新性、普适性及对科学研究的推动作用,鼓励跨学科技术开发以应对复杂生物学问题。

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Nature Methods官网截图

期刊主页https://www.nature.com/nmeth/

期刊简介

Nature Methods由Nature Portfolio主办,创刊于2004年,是方法学领域的同行评审期刊,专注于生物学及相关领域的新方法开发、优化及应用,涵盖拉曼成像、空间蛋白质组学、计算生物学等。期刊发表具有重大技术突破或应用影响的方法、协议及技术评论,目标读者包括生物学家、方法开发者及跨学科研究者。文章需展示方法的原创性、普适性或显著提升研究效率。期刊采用严格同行评审,初审周期约7-10天。支持开放获取(OA)及订阅模式,2024年强调拉曼成像及空间蛋白质组学专题。

期刊相关信息

  • 影响因子:32.1(2024年)
  • 中国科学院分区:1区(生物学-生化研究方法)
  • 出版费用:开放获取费用(APC)为6990美元(2025年);支持订阅模式(非OA无需APC)。
  • 出版频率:月刊(在线及印刷版)。

投稿注意事项

  • 文章长度:建议8-12页(双栏),含图表和参考文献;超12页需编辑批准。
  • Cover letter:需提交,说明方法的创新性、技术意义及适合Nature Methods的理由,突出方法的应用潜力。
  • 初始投稿格式:使用Nature双栏模板(Word或LaTeX),初稿提交PDF,图表嵌入正文。
  • 数据可用性:所有文章需公开数据集,存放在推荐存储库(如Figshare、Zenodo、GEO)并提供DOI,符合FAIR原则。
  • 代码可用性:涉及算法或处理的需提供代码(如GitHub链接)或补充信息,强制要求。
  • 预印本政策:接受bioRxiv、arXiv等预印本,需在投稿时声明。
  • 审稿周期:初审约7-10天,编辑筛选后同行评审(2-4位审稿人)。
  • 出版费用减免:开放获取文章的无资助研究可申请APC减免,联系Nature出版办公室(openaccess@nature.com)。
  • 开放获取选项:支持开放获取(需APC)或订阅模式。
  • 彩图费用:订阅模式下彩图费用为1,000美元/页;OA文章无彩图费用,包含在APC中。
  • 投稿限制:允许一轮主要修订,拒绝后需编辑许可重新提交。
  • 语言润色:建议使用Nature推荐的AJE(American Journal Experts)服务,润色证明可随稿件提交。
  • 扩展论文:扩展论文需新增≥50%内容,提交原文章供审查。
  • 伦理要求:涉及人类或动物数据的需提供伦理委员会批准编号,遵循《赫尔辛基宣言》或动物伦理指南。
  • 提案要求:综述或评论文章需提交提案(标题、300字摘要、大纲、目标读者群),发送至nmeth@nature.com。

文章类型

Nature Methods主要发表以下类型文章:

  • Research Article:原创方法研究(8-12页),需展示重大技术突破或应用潜力。
  • Brief Communication:简短方法报告(2-4页),介绍重要技术改进,需高影响力。
  • Review:综述文章(8-12页),总结方法学进展,需编辑邀请。
  • Perspective:观点文章(1-3页),讨论方法学趋势或技术,需编辑邀请。
  • News and Views:简讯文章(1-2页),分析近期方法或技术,需编辑邀请。
  • Comment:评论文章(1-2页),讨论方法学趋势(如拉曼成像),需编辑邀请。
  • Correspondence:针对已发表文章的学术回应,需编辑批准。
  • Protocol:详细实验协议(8-12页),提供可重复的方法步骤。

投稿通过Manuscript Tracking System提交,Review/Comment/Perspective/Protocol需先提交提案至nmeth@nature.com。

文章结构

一篇典型的Research Article包括以下部分,每部分附简短英文示例:

  • 标题:简洁、描述性,突出方法主题,最大15字。
    示例
    Advancing Raman Imaging for Biology
  • 作者信息:列出所有作者的姓名、单位、电子邮件及ORCID。
    示例
    Department of Bioengineering, Stanford University, USA
    Sarah Lee, Anil Kumar
    State Key Laboratory of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China
    Wei Chen
  • 贡献声明:明确每位共同作者的贡献,遵循CRediT标准。
    示例
    S.L. designed the Raman imaging method; A.K. conducted experiments; W.C. analyzed data.
  • 通信作者:指定通信作者,提供电子邮件及ORCID。
    示例
    Correspondence to: Wei Chen (wei.chen@cas.cn)
  • 摘要:概述方法背景、开发、结果及应用,最大150字,无参考文献。
    示例
    This study advances Raman imaging for biology. Enhanced resolution enables cellular mapping. Code at GitHub (github.com/raman2025). This boosts tissue analysis.
  • 关键词:提供4-8个关键词,便于检索。
    示例
    Raman imaging, vibrational microscopy, biological discovery, FAIR principles
  • 引言:介绍方法背景、问题及目标,需包含参考文献。
    示例
    Raman imaging enhances biological analysis [1]. Resolution limits persist [2]. This study optimizes imaging sensitivity.
  • 正文:分节描述方法开发、验证、应用,使用子标题。
    示例
    Raman Imaging Optimization
    Enhanced signal-to-noise via novel optics (figure 1) [3].
  • 结论:总结方法改进,提出科学或应用前景。
    示例
    Conclusion
    Optimized Raman imaging improves tissue mapping. Future work will scale applications.
  • 参考文献:列出所有引用文献(详见第6节)。
    示例
    [1] Lee S et al. Nat. Methods 22, 123-129 (2025).
  • 致谢(可选):感谢资助机构或个人,包含资助编号。
    示例
    Funded by NSFC grant 1234567. We thank the Biophysics Lab.
  • 作者简介(可选):简述作者背景、教育经历及研究兴趣。
    示例
    Sarah Lee received the Ph.D. degree from Stanford in 2023. Her research focuses on bioimaging.
  • 伦理声明:包括利益冲突声明及伦理合规。
    示例
    Competing interests: The authors declare no competing interests.
    Ethics approval: Not applicable.
    Data availability: Data at Figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.123456.
    Code availability: Code at GitHub: https://github.com/raman2025.
  • 补充信息(可选):提供额外数据、方法或代码。
    示例
    Supplementary Information S1: Raman imaging datasets.

格式要求

Nature Methods要求初稿使用Nature双栏模板(Word或LaTeX),建议8-12页,修订稿需符合出版规范。以下是具体要求:

字体和字号

  • 正文:Times New Roman或Arial,11号字,1.5倍行距。
  • 一级标题:粗体,12号字,首字母大写
  • 二级标题:粗体,11号字,首字母大写
  • 图表标题:粗体,9号字

页面布局

  • 使用 A4纸张,单栏或双栏(视模板)。
  • 页边距:上2.5厘米,下2.5厘米,左右2厘米
  • 行距:1.5倍行距,段前段后6点间距。

图表格式

  • 图表嵌入正文,初稿为PDF,修订稿需单独上传高分辨率文件。
  • 图表标题置于下方,Times New Roman或Arial,9号字,居中
  • 图表文字:9号字,确保清晰。
  • 图表分辨率:至少600 DPI,推荐格式为TIFF、EPS或高分辨率JPEG
  • 颜色选择:支持彩色,建议高对比度(如蓝/黄),避免红绿以照顾色盲读者。
  • 图例:每幅图说明不超过150字,置于图下方。
  • 版权:需获得受版权保护的图表许可,提交许可文件。

公式与术语

  • 公式居中,右对齐编号,如 (1),文中称为“equation (1)”。
  • 术语遵循国际方法学标准(如“Raman imaging”而非“Raman spectroscopy”)。
  • 示例:
    (1) I = f(λ) + g(S)

表格

  • 表格嵌入正文,包含标题和图例,置于页面顶部或底部。
  • 大型表格作为补充信息(如Excel)。

参考文献格式

Nature Methods要求使用Vancouver风格,按文中出现顺序编号,文中以方括号引用(如 [1])。参考文献需准确,优先引用期刊文章。以下是示例:

  • 期刊文章
    [1] Lee S, Kumar A. Nat. Methods 22, 123-129 (2025).
  • 会议论文
    [2] Chen W et al. Bioimaging Conf. 2025, 130-135 (2025).
  • 书籍
    [3] Pawley JB. Handbook of Biological Confocal Microscopy. Springer, 2006.
  • 数据集
    [4] Lee S et al. Raman imaging dataset. Figshare, 2025. Available: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.123456
  • 预印本
    [5] Kumar A et al. Raman imaging optimization. bioRxiv 2501.12345, Jan. 2025. Available: https://doi.org/10.1101/2501.12345

伦理声明

  • 利益冲突:需声明所有作者的利益冲突(如“无利益冲突”)。
  • 伦理合规:涉及人类或动物数据的需提供伦理委员会批准编号,遵循《赫尔辛基宣言》或动物伦理指南。
  • 数据可用性:所有文章需声明数据集存储库及访问方式,符合FAIR原则。
  • 代码可用性:涉及算法或处理的需提供代码存储库或补充信息,强制要求。
  • 示例:
    Competing interests: The authors declare no competing interests.
    Ethics approval: Not applicable.
    Data availability: Data at Figshare: https://doi.org/10.6084/m9.figshare.123456.
    Code availability: Code at GitHub: https://github.com/raman2025.

补充信息

  • 补充信息作为单独文件提交,格式为PDF、Excel、MP4(H.264编码,16:9)或ZIP
  • 包含大型数据集、方法、代码或视频,无额外费用。
  • 示例:
    Supplementary Information S1: Raman imaging datasets.

投稿流程

作者需通过Manuscript Tracking System提交论文。流程如下:

  • 注册并关联ORCID,指定通信作者(需符合Nature作者标准)。
  • 综述、评论或协议文章需先提交提案至nmeth@nature.com,包含标题、300字摘要、大纲及目标读者群。
  • 获批后上传Nature模板稿件(PDF)、cover letter、图表(嵌入PDF)及补充信息。
  • 提供利益冲突声明数据/代码可用性声明伦理声明
  • 提交推荐审稿人(可选,3-5人,需提供姓名、邮箱及理由)。
  • 在Manuscript Tracking System跟踪审稿状态,初审约7-10天。
  • 修订稿需提交:修改稿(Word/LaTeX)、审稿回复(逐点回应)、高分辨率图表。
  • 可联系编辑部(nmeth@nature.com)查询状态或申请APC减免(开放获取文章)。

最后

Nature Methods作为方法学领域的平台,以其高影响力方法开发、优化及对拉曼成像、空间蛋白质组学的关注,推动了生物学及相关领域的技术革新。本文基于官网指南及拉曼成像案例,系统解析了从标题到补充信息的规范,旨在为您的投稿提供坚实支持。投稿需严格遵循Nature格式规范。

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